Воссоздание перца.
Трехмерная реконструкция болгарского перца, купленного у молдаван около метро Крылатское.
Приборы и материалы.
Методика Подготовительный этап начинается с покупки достаточно крупного, плотного стручка болгарского перца. По возможности равномерно и достаточно тонко (в нашем случае - порядка 3-4 мм.) перец нарезается по длинной оси (будем считать это саггитальной проекцией). Полученные срезы оцифровывались - в моем случае планшетным сканером Mustek. 
Итак, наша здача получить 28 (именно столько мне удалось cделать срезов) выровненных картинок одного размера (512x512). Существуют программы для ориентирования и центровки изображений по реперным точкам или по центру масс (что не всегда применимо). Я делал это на глаз, что значительно снижает ценность реконструкции. Далее, следовало бы откалибровать изображение, но я забыл положить в сканер линейку :) и поэтому дальнейших расчетов не будет. Хотя можно было посчитать и относительные размеры. После получения изображения можно отвлечься и приготовить греческий салат - нарезать кубиками мягкую брынзу типа фетакии, порезать на четыре части очищенные срезы оцифрованного перца, добавить черных маслин без косточек, листья салата, зелень и маленькие красные или желтые помидоры. Можно дополнить куриным мясом или сухариками. Полить все оливковым маслом и подавать к столу. Большинство программ для трехмерной реконструкции ориентированы на изображения, получаемые с магнитно-резонансного томографа. Это влечет за собой два вывода. Первый - необходимо снижение цвета до 8bit серого, а второй - лучше всего работать с общепринятыми форматами Analyze (пара файлов - *.img и *.hdr) или DICOM (масса вариантов, расширение *.dcm или другие) Здесь видно, как я перевел картинку в 8bit серый и применил LUT (Lookup table) псевдоколорирование, чтобы лучше различать (визуально) сердцевину перца. Это можно сделать во многих редакторах, мне больше по душе ImageJ, кстати, и к ней есть модули, позволяющие делать реконструкцию и обсчитывать трехмерные модели. 
Для перевода серии картинок в формат Analyze я воспользовался MRICro, в ней же можно воссоздать трехмерное изображение, посмотреть срезы по другим осям (только необходимо применить к нашей серии картинок функцию Convert anisotropic image to isotropic). 
В Osiris, как и в MRIcro можно сегментировать изображение, выделить интересующие области и измерить объемы. Например, посчитать объем пространства внутри перца, свободного для закладки фарша, или соотношение съедобной и вырезаемой частей. Так же, имея трехмерную модель можно рассчитать наиболее выгодную укладку перцев в сумки и чемоданы. 3D doctor даже в порезаной демо версии умеет экспортировать модель в AutoCad или 3D Studio. Но вращающееся изображение виртуального перца пришлось делать все же в ImageJ ( Image / Stacks / 3Dproject) 3-х мерный перец  (Animated GIF 82Kb)
|
