Кто скажет что трубки - это не биологический объект?Ну можно конечно спорить, но для первого примера подойдет и такой. Математиков прошу свернуться и удалиться куда-нибудь.
Приборы и материалы.
Я дал ссылку на красивую, отсканенную брошюру Dunhill, но есть более удобная для нашей цели упрощенная табличка с 28 трубками (все почему-то пишут что их 36, почему и куда из нее исчезли еще восемь? ). Метод и результаты 1) Открываем изображение в программе ImageJ. Применяем фильтр Binary/Treshold. Таким простейшим образом сегментируем изображение. Получается битовая картинка. Черная трубка на белом фоне. Найдем инструмент, который в Photoshop называется Magic Wand, щелкнем им по белому фону картики - выделим желаемую область для обработки. Поскольку я хотел работать с отдельными частями трубки, пришлось их принудительно разделить. Photoshop можно использовать для такой же первичной обработки, но считать все равно в IJ будем. 
2) Следующий этап. Analyze/Set Measurements. Отмечаем параметры объекта которые мы хотим получить (В моем случае оси эллипса и еще, для полноты площадь). Все цифры у нас конечно в пикселях, потому что мы не калибровали картинку. Дальше выбираем Analyze/Analyze Particles. (Отметим Exclude Edge Particles - не считаем рамку по краю; Отметим Minimum Size - 100 пикселей, чтобы не считать всякий мусор, остальное по желанию. Я пожелал картинку с обводами на выход, и еще эллипсы). 
3) Теперь у нас две картинки и табличка. Картинка с эллипсами наглядна, но бесполезна, картинка с номерами частей полезна для того чтобы ориентироваться в таблице. Кстати, (1) - мундштук, (2) - чашка трубки и чубук. Таблица отправляется туда, где вы хотите с ней работать, в моем случае - в Statistica (пришлось в файле заменять десятичный разделитель с точек на запятые).
4) Немного аналогичных мучений и вот вам картинка с модуля кластерного анализа в Statistica (Complete linkage, Euclidean distances). Сравнивал трубки я по большим и малым осям эллипсов. Эк их кластеризовало-то по форме чубука и мундштука! Для любителей строить графики - просто наслаждение. 
Обсуждение Отчетливо видно, что даже после таких нехитрых манипуляций мы получили инструмент, позволяющий сортировать трубки и строить предположения об происхождении их формы и взаимном влиянии друг на друга. Легко добавить к уже полученным результатам историческую ретроспективу и мы получим полноценное филогенетическое древо. Единственное, от чего я предостерегу молодых исследователей этого вопроса - помните о разнице между гомологией и гомогенией, не курите пересушенный табак и вовремя чистите трубку. Литература 1.Ibid. |
